
如何解析 umap 聚类图? - 知乎
UMAP (Uniform Manifold Approximation and Projection)是一种 非线性降维算法。通过降维,将高维数据分布在一个低维空间中,使得具有相似基因表达模式的细胞在图中聚集在一起,形成不同的聚类 …
UMAP图的横纵坐标分别代表什么啊? - 知乎
很显然,Dimplot是实现不了的。 UMAP降维图本质也是散点图,只需要将作图数据导出,ggplot2就可以实现任何你想要的修饰了。 首先我们设置下颜色,并将作图的数据导出,导出的数据包含UMAP两 …
UMAP图的横纵坐标分别代表什么啊? - 知乎
UMAP(Uniform Manifold Approximation and Projection)是一种非线性降维算法,专门用于将高维数据(如单细胞RNA-seq、基因组学、图像特征)映射到低维空间(通常是2D或3D),同时保留数据的 …
在哪里可以找到大量数学建模美赛的优秀论文? - 知乎
2008年 2008ICM特等奖论文全集(The UMAP Journal v. 29 no. 2 ) 美国数学建模大赛题目+05--07部分优秀论文 - 经济金融数学专区 - 经管之家 (原人大经济论坛) 数学建模优秀论文|MATLAB技术论坛 - …
生信分析 降维分析的意义是什么? - 知乎
基本概念 基本概念:PCA: 即主成分分析,是数据降维的方法。从高纬数据中提取数据的特征向量(成分),转换为低维数据并且用二维或者三维的图来展示这些特征。从特征向量中提取最能体现数据特 …
【单细胞测序】如何看单细胞文献的轨迹分析(Monocle3)? - 知乎
轨迹分析(也叫Pseudotime Analysis)的核心,简单说就是给静态的单细胞测序数据“加个时间轴”: 它靠算法(比如Monocle3先用UMAP或PCA降维,再建个最小生成树)推断细胞在“伪时 …
ue文件夹有关卡但是打开工程看不到关卡? - 知乎
Nov 13, 2023 · 版本不对,我记得5.3版本的,和其他版本都不通用。 你不要复制,而是用虚幻自己的迁移操作。 并且迁移到对应版本的引擎。 如果你非要迁移到不同的版本,那就只能打开两个引擎,在 …
umap图簇1和簇14老是重叠在一起,调整了dim,mindist,neighbors …
umap图簇1和簇14老是重叠在一起,调整了dim,mindist,neighbors值都不能分开? 我在进行单细胞测序的分析,我把把两个不同来源的数据混合起来分析的,一个来自GEO数据集只有对照组,另一个 …
UMAP和T-SNE能否进行逆变换? - 知乎
经过UMAP或T-SNE降维后的数据能否进行逆变换,就像PCA的inverse_transform一样回到原始维度。如果不能,…
如何确定单细胞的分群是合适的? - 知乎
7. UMAP/TSNE可视化:通过不同分辨率下的UMAP或TSNE图来观察细胞群的分布,如果随着分辨率的增加,细胞群的分离度没有明显变化,那么可以选择一个较低的分辨率作为合适的分群数量。